硫酸软骨素是动物软骨中蛋白聚糖的主要成分，是具有少数几种细菌的荚膜多糖。相比于动物提取法，微生物发酵法具有工艺条件温和，原料丰富，无污染等优点，且产物提取率高，所含杂质少，已成为国内外研究的热点。微生物发酵法提取硫酸软骨素采用的主要菌株有巴斯德杆菌、大肠杆菌和枯草芽孢杆菌三种，它们都能利用以尿苷二磷酸（UDP）前体形式存在的单糖。刘立明等人发明了一种产硫酸软骨素菌株（枯草芽孢杆菌）的筛选方法，将菌种接种于营养肉汤培养基中，培养24h后离心收集发酵液，发酵液采用内标法经高效液相色谱进行定性分析，使得硫酸软骨素标准品峰高增高的菌株即为产硫酸软骨素的枯草芽抱杆菌。并用该菌株发酵法生产出硫酸软骨素。围绕发酵法生产硫酸软骨素这一研究主题，国内外研究人员已在高产微生物菌株筛选与改良、发酵条件优化与控制、硫酸软骨素合成机制与调控 机理等方面开展了卓有成效的研究工作。为发酵法生产硫酸软骨素的工业化奠定了基础。

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