动物提取法主要是碱提液醇沉工艺、酶法提取工艺、碱－酶提取法、碱提－酶解－醇沉法、反向沉淀法、超声波辅助法、超声波辅助－碱－双酶－乙醇法、氯化十六烷基吡啶沉淀法及有机溶剂沉淀法等，但制得的硫酸软骨素均为粗品。高分子量的硫酸软骨素，由于其表观黏度高、结构复杂及细胞膜的选择通透性等因素，造成了其生物利用率低、口服吸收差及疗效不稳定。而低分子质量CS具有生物利用度高和活性强等功能特性，越来越受到人们的重视。徐峥嵘等人以酸性粘多糖酶（透明质酸酶、硫酸软骨素酶和肝素酶）裂解高分子量硫酸软骨素，并用截留分子量为5000u的超滤 膜将生成的低分子量硫酸软骨素及时滤除，防止其进一步裂解，从而得到高产率的低分子量硫酸软骨素。此方法克服了硫酸软骨素酸水解工艺制备产品的分子量分布宽，产品得率低的缺点，可高效、大批量制备低分子量硫酸软骨素，得率在80%以上。史敏娟等人以过氧化氢+铜离子（Ⅱ）体系自由基法降解制备了低相对分子质量CS，结果表明：重均分子量从56596降到6906，己糖醛酸、氨基己糖及硫酸根等主要成分变化不大，差异不显著，降解前后热分解特性一致。此方法不会造成硫酸软骨素主要成分的损失，具有较大的应用前景。

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